故宫博物院南院期以宏观的文化视野，在原有华夏文物丰富的典藏基础上，重新阐述中华、波斯、印度 三大文明绵密交织成的亚洲文化地图，展现国宝典藏品的时空脉络与文化背景。
基地位于朴子溪旁，在嘉南平原一片绿色的蔗田与稻田之中，跨径约140米的至美桥横越南端的人工湖，引导人群由入口广场，沿景观步道，接引至博物馆的竹林中庭。
为避免湖中落柱影响原有人工湖底防水效果，选择以不落桥墩之结构形式，采用大跨度钢制单拱桥，桥体结构以轻量化设计为原则，结构支撑仅依赖主拱与S型桥面板间的拱梁与肋板，随着桥面板的弯曲形成变化的序列，呈现出视觉角度渐变的韵律感。桥面总宽7.2米，平时主要提供民众步行为主，必要时可供电动小汽车通行；在特殊节日之时，大量人潮可以停留于桥面观赏湖面烟火、水上表演等特殊活动。
建筑形体以西侧的黑色实体「浓墨」和东侧的白色虚体「飞白」在弧形的两个端点交汇。建筑师精心设计了这两个对比极大的量体，相环相扣的交织与结合。
量体的悬臂端点，在施工过程中是个既有趣又有挑战性的难题。在主结构完成之前，45根临时柱子支撑着悬浮结构。历史性的一刻归功于支架被拆除的当下，故宫博物院南院骄傲的矗立在美丽的嘉南平原之中，证实此结构设计的成功性和突破性。
行政与教育推广功能在虚量体「飞白」，建筑墙面以浅灰色复层低辐射玻璃，减少嘉南平原的烈日曝晒与湖面的阳光反射；外露的钢骨结构柱，以3.6米间距渐次排列，最高处为27米高。透过绿建材与绿能等设计，展现整体建筑环境的「绿色内涵」，也同时符合「钻石级绿建筑」。此外，因应南台湾日照特性，建筑西侧以实量体遮挡西晒的不适，东侧则以外露钢构出檐，兼具遮阳功效。
典藏展览功能的实量体以黑色调为主，建筑外墙图样撷取青铜器上龙纹及云纹，以现代数字化点阵排列将纹样重新图像化，以黑色马赛克做为底色，再将总数36,000多片的铸铝圆盘外挂于弧型墙面上所组成。圆盘反射移动的阳光，并随着参观者步移景异，在独特设计的弧形立面上呈现「云中行龙」的图案，这是运用现代科技化的工艺手法，传达另一种构筑上的视觉效果。
建筑的南北两端都开了大窗为了通风及采光。交接处的内部为公共空间和展览室的穿廊，在参观动线的 入口和出口处界定公共与管制区活动范围的界线。
博物馆周边的景观设计，撷取嘉南平原上原有的田埂织理，透过平原上原生物种的找寻，恢复在地景观，以多种类的植栽体系，让建筑在起伏的草原地景中升起。希冀以尊重现有地貌的态度，结合有机元素塑造的微地形，加上雨水及地表径流，创造能自我调节、平衡而丰富的多样性环境。
